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如果以非洲直立人到达中国的时间为节点，那么现在在中国境内还没有发现获得普遍认可的年代早于160万年的古人类化石。人们熟知的北京猿人（北京人）可以确认的时间是50万年前。而蓝田公王岭直立人可能是中国境内发现的最早古人类成员，距今约163万年，但尚未得到确认。云南发现的两颗元谋人牙齿化石据称年代久远，距今170万年，可由于牙齿出土的具体地点和地层位置难以确定，其年代的可靠性存疑。此外，陕西蓝田上陈遗址发现的石器确认年代距今212万年，不过并未发现人类化石，也无法对古人类在中国出现的最早时间下定论。也就是说，以距今160万年左右为时间节点，无论是遗传（基因）还是化石证据都表明，现代中国人起源于非洲。
到了2001年，复旦大学金力团队在《科学通报》杂志发表“Y染色体遗传学证据支持现代中国人起源于非洲”的论文，从男性Y染色体DNA的角度分析认为现代中国人的祖先是非洲人。金力团队利用3个古老的Y染色体上的单核苷酸多态性（SNP）作为研究重点，即M89、M130和YAP这3个古老的Y-SNP，它们均是在Y染色体M168突变型的基础上产生的3个突变类型。金力团队从中国各地搜集了9988例男性随机样本，研究发现，所有样本都只具有M168的3种突变。除此之外，没有其他新的突变类型出现。
美国人类学家沃波夫、索恩和吴新智教授于1984年便提出了“多地起源说”，但是更早提出“多地起源说”的是参与研究北京人化石的德国解剖学家和体质人类学家魏敦瑞。1946年，魏敦瑞提出“人类演化多元”假说，认为人类演化有4条路线，分别是东亚、欧洲、非洲和东南亚到大洋洲路径。在东亚人类演化路径上，魏敦瑞明确认定北京猿人-山顶洞人-蒙古人种的祖先后代关系，限于当时人类学发展和考古材料，实际上魏敦瑞认定北京猿人就是现代中国人的祖先。
根据之一是在中国不同地区都发现了不同年代的人类化石，表明在中国土地上人的活动和演化是持续的。从更为久远的年代看，有距今约170万年的云南元谋人，距今115万年至60万年的陕西蓝田人，距今60万年至35万年的南京人，距今50万年至20多万年的北京人，距今约40万年的山东沂源人，距今30万年至20万年的安徽和县人，距今十几万年的广东马坝人等。从现代人最近的祖先晚期智人生活的年代看，中国境内有距今5万年至3.7万年的内蒙古鄂尔多斯河套人，距今4万年至3万年的四川资阳人，还有距今3.3万年至2.3万年的广西柳江人。
此外，从中国古人类化石的牙齿来看，有一个明显区别于其他人种的解剖特征，即铲形门齿。中国人上门齿（上颌两颗中门齿）的两边缘翻卷成棱，中间低凹，像一把铲子。从距今170万年的元谋猿人到50万年的北京猿人，再到距今十几万至几万年的晚期智人、1万年以来的新石器时代东亚人，80%以上都拥有铲形门齿。在日本、韩国等东亚近邻民族中，铲形门齿的比例也相当高，而在欧洲、非洲各族群中，铲形门齿极少。现代欧洲人、非洲人铲形门齿的比例只有约5%和10%。
现代中国人起源于本土不仅限于化石证据，还有遗传学根据。中国科学院古脊椎动物与古人类研究所付巧妹团队2017年在《当代生物学》杂志上发表了首个针对中国古人类的基因组研究成果，他们根据北京房山田园洞的一名男性个体基因组样本破译了中国第一例古人类全基因组，确定4万年前的田园洞人具有明确的东亚人基因。有意思的是，该古人类全基因组与某个古欧洲人群还有特殊的遗传联系，这意味着，当时亚洲人群具有多样性的祖先，并非只有迁徙而来的非洲智人。
对于“中国境内古人类是现代中国人祖先吗”这一课题，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所认为，未来的研究需要以东亚大陆古人类化石和全新世人类遗骸为主要研究材料，通过化石的体质形态、遗传结构（古DNA、古蛋白）及伴生的考古学证据等综合研究手段，对不同类别化石特征的形态表现特点、时代变化、区域变异进行系统深入研究，从而分析论证东亚古人类和现代中国人群在年代学和形态学上是否具有连续性。只有搞清楚现代中国人群到底来自哪里，他们是否为当地古老型人类的直接后代等问题，才能揭示东亚大陆人类的演化规律，厘清中国人演化的脉络。
